Dados do Acervo - Dissertações

Número de Chamada   
 
572.86    S192g    DIS   
Autor Principal Sampaio, Vanderson de Souza
Entradas Secundárias - Autor Silva, Artur Luiz da Costa da ; orient.
Universidade Federal do Pará. Centro de Ciências Biológicas Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas
Título Principal O Genoma mitocondrial de Cebus Capucinus (Cebidade, Primates) / Vanderson de Souza Sampaio; orientador, Artur da Costa da Silva
Publicação 2005.
Descrição Física x,57 f. : il. ; 31 cm
Notas Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Pará, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas, 2005
Inclui referências bibliográficas
Resumo: O gênero Cebus é um dos grupos de primatas mais utilizados como modelos para pesquisa biomédica e é também objeto de estudo nas áreas ecológica e comportamental. A difícil classificação das espécies pertencentes a esse gênero é devida a uma predisposição dos indivíduos a uma variação individual muito grande. A espécie Cebus capucinus é utilizada no presente trabalho como modelo para a abordagem de sequenciamento de genomas mitocondriaís. O uso do genoma mitocondrial como ferramenta para estudos evolutivos tem provado ser uma boa abordagem. Esse genoma tem demonstrado ser uma rica fonte de informações sobre a evolução dos organismos, e o sequenciamento do mesmo pode dar uma idéia mais geral desse processo evolutivo (Boore, 1999). A abordagem de sequenciamento utilizada no presente trabalho é o método de shotgun, que tem como característica peculiar, a necessidade de um robusto suporte de bioinformática, que é uma sub área da biologia com putaci on ai responsável pelo armazenamento, organização e análise da informação gerada por um projeto genoma. O presente trabalho tem como principal objetivo o desenvolvimento de um protocolo padrão para o sequenciamento e a análise dos genomas mitocondriais dos macacos do Novo Mundo utilizando como modelo a espécie Cebus capucinus, bem como a análise das particularidades desse genoma e a publicação das seqüências em bancos de dados disponiveis na Internet. A ferramenta MitoGen 1.0, bem como sua versão voltada para a internet: o WMitoGen 1.0, ambas criadas a partir da união de vários módulos utilizados na implementação do pipe/ine de tratamento e montagem daso gênero Cebus é um dos grupos de primatas mais utilizados como modelos para pesquisa biomédica e é também objeto de estudo nas áreas ecológica e comportamental. A difícil classificação das espécies pertencentes a esse gênero é devida a uma predisposição dos indivíduos a uma variação individual muito grande. A espécie Cebus capucinus é utilizada no presente trabalho como modelo para a abordagem de sequenciamento de genomas mitocondriaís. O uso do genoma mitocondrial como ferramenta para estudos evolutivos tem provado ser uma boa abordagem. Esse genoma tem demonstrado ser uma rica fonte de informações sobre a evolução dos organismos, e o sequenciamento do mesmo pode dar uma idéia mais geral desse processo evolutivo (Boore, 1999). A abordagem de sequenciamento utilizada no presente trabalho é o método de shotgun, que tem como característica peculiar, a necessidade de um robusto suporte de bioinformática, que é uma sub área da biologia com putaci on ai responsável pelo armazenamento, organização e análise da informação gerada por um projeto genoma. O presente trabalho tem como principal objetivo o desenvolvimento de um protocolo padrão para o sequenciamento e a análise dos genomas mitocondriais dos macacos do Novo Mundo utilizando como modelo a espécie Cebus capucinus, bem como a análise das particularidades desse genoma e a publicação das seqüências em bancos de dados disponiveis na Internet. A ferramenta MitoGen 1.0, bem como sua versão voltada para a internet: o WMitoGen 1.0, ambas criadas a partir da união de vários módulos utilizados na implementação do pipe/ine de tratamento e montagem das seqüências, se mostraram eficientes para o que se propõem. Com exceção dos genes ND2, COXII e ATP6, que se encontram parcialmente representados, os demais gnes foram completamente seqüenciados e encontram-se representados nos três contigs obtidos ao final do sequenciamento. Foram anotados também 14 dos 22 tRNAs geralmente encontrados nos genomas mitocondrias de vertebrados. A genômica comparativa revelou, entre outras coisas, que o ND6 é o gene que apresenta maior taxa de evolução, enquanto que o COX1 ´[e o menor taxa evolutiva.
Assuntos Genoma
DNA mitocondrial
Bioinformática
Primata