Número de Chamada
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572.86 S192g DIS
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Autor Principal
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Sampaio, Vanderson de Souza
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Entradas Secundárias - Autor
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Silva, Artur Luiz da Costa da ; orient. Universidade Federal do Pará. Centro de Ciências Biológicas Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas
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Título Principal
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O Genoma mitocondrial de Cebus Capucinus (Cebidade, Primates) / Vanderson de Souza Sampaio; orientador, Artur da Costa da Silva
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Publicação
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2005.
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Descrição Física
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x,57 f. : il. ; 31 cm
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Notas
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Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Pará, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-graduação em Ciências Biológicas, 2005
Inclui referências bibliográficas Resumo: O gênero Cebus é um dos grupos de primatas mais utilizados como
modelos para pesquisa biomédica e é também objeto de estudo nas áreas
ecológica e comportamental. A difícil classificação das espécies pertencentes a esse gênero é devida a uma predisposição dos indivíduos a uma variação
individual muito grande. A espécie Cebus capucinus é utilizada no presente
trabalho como modelo para a abordagem de sequenciamento de genomas
mitocondriaís. O uso do genoma mitocondrial como ferramenta para estudos
evolutivos tem provado ser uma boa abordagem. Esse genoma tem demonstrado ser uma rica fonte de informações sobre a evolução dos organismos, e o sequenciamento do mesmo pode dar uma idéia mais geral desse processo evolutivo (Boore, 1999). A abordagem de sequenciamento utilizada no presente trabalho é o método de shotgun, que tem como característica peculiar, a necessidade de um robusto suporte de bioinformática, que é uma sub área da biologia com putaci on ai responsável pelo armazenamento, organização e análise da informação gerada por um projeto genoma. O presente trabalho tem como principal objetivo o desenvolvimento de um protocolo padrão para o sequenciamento e a análise dos genomas mitocondriais dos macacos do Novo Mundo utilizando como modelo a espécie Cebus capucinus, bem como a análise das particularidades desse genoma e a publicação das seqüências em bancos de dados disponiveis na Internet. A ferramenta MitoGen 1.0, bem como sua versão voltada para a internet: o WMitoGen 1.0, ambas criadas a partir da união de vários módulos utilizados na implementação do pipe/ine de tratamento e montagem daso gênero Cebus é um dos grupos de primatas mais utilizados como modelos para pesquisa biomédica e é também objeto de estudo nas áreas ecológica e comportamental. A difícil classificação das espécies pertencentes a
esse gênero é devida a uma predisposição dos indivíduos a uma variação
individual muito grande. A espécie Cebus capucinus é utilizada no presente
trabalho como modelo para a abordagem de sequenciamento de genomas
mitocondriaís. O uso do genoma mitocondrial como ferramenta para estudos
evolutivos tem provado ser uma boa abordagem. Esse genoma tem demonstrado ser uma rica fonte de informações sobre a evolução dos organismos, e o sequenciamento do mesmo pode dar uma idéia mais geral desse processo evolutivo (Boore, 1999). A abordagem de sequenciamento utilizada no presente trabalho é o método de shotgun, que tem como característica peculiar, a necessidade de um robusto suporte de bioinformática, que é uma sub área da biologia com putaci on ai responsável pelo armazenamento, organização e análise da informação gerada por um projeto genoma. O presente trabalho tem como principal objetivo o desenvolvimento de um protocolo padrão para o sequenciamento e a análise dos genomas mitocondriais dos macacos do Novo Mundo utilizando como modelo a espécie Cebus capucinus, bem como a análise das particularidades desse genoma e a publicação das seqüências em bancos de dados disponiveis na Internet. A ferramenta MitoGen 1.0, bem como sua versão voltada para a internet: o WMitoGen 1.0, ambas criadas a partir da união de vários módulos utilizados na implementação do pipe/ine de tratamento e montagem das seqüências, se mostraram eficientes para o que se propõem. Com exceção dos genes ND2, COXII e ATP6, que se encontram parcialmente representados, os demais gnes foram completamente seqüenciados e encontram-se representados nos três contigs obtidos ao final do sequenciamento. Foram anotados também 14 dos 22 tRNAs geralmente encontrados nos genomas mitocondrias de vertebrados. A genômica comparativa revelou, entre outras coisas, que o ND6 é o gene que apresenta maior taxa de evolução, enquanto que o COX1 ´[e o menor taxa evolutiva.
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Assuntos
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Genoma DNA mitocondrial Bioinformática Primata
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